Nous vous rappelons que, afin de garantir l'accès de tous les inscrits aux salles de réunion, l'inscription aux réunions est gratuite mais obligatoire.
Inscriptions closes à cette réunion.
48 personnes membres du GdR ISIS, et 133 personnes non membres du GdR, sont inscrits à cette réunion.
Capacité de la salle : 200 personnes.
Le rebond épidémique actuel nous a poussé à repenser l'organisation pour cette 16e édition des JIONC. Contrairement à la coutume, les journées se tiendront à distance via Cisco WebEx les 31 mars et 1er avril 2021.
Les liens de connexion sont :
Nous aurons le plaisir cette année de vous proposer une présentation invitée donnée par Virginie Chamard (Institut Fresnel, CNRS, Univ. Aix-Marseille) intitulée : "X-ray Bragg ptychography: a new approach to help deciphering biomineralization pathways".
Comme chaque année, nous sollicitons aussi des propositions de communications de nature théorique et applicative, sur les thèmes suivants (liste non exhaustive) :
Merci de faire parvenir vos propositions (max. 1 page par résumé) par courrier électronique aux organisateurs des journées, le 8 mars au plus tard, en mentionnant votre préférence pour une présentation orale ou poster.
Des modèles de soumission (formats Word et LaTeX) pour les propositions sont à télécharger à l'adresse suivante : https://tinyurl.com/2hr6y8pq
Organisateurs de la journée :
8H30-9H00 : ACCUEIL + INTRODUCTION DES JIONC 2021 (Animateurs : Nicolas Verrier, Corinne Fournier, Matthieu Boffety)
9H00-9H50 : CONFÉRENCE INVITÉE (Animateur : Matthieu Boffety)
« X-ray Bragg ptychography: a new approach to help deciphering biomineralization pathways »
Virginie Chamard
Aix-Marseille Université, CNRS, Centrale Marseille, Institut Fresnel UMR 7249, Marseille, France
9H50-10H30 : IMAGERIE BIOMEDICALE (Animateurs : Nicolas Ducros, Carole Frindel)
« Blood perfusion assessment in the small bowel using a novel multimodal imaging platform »
Silvère Ségaud, Luca Baratelli, Enagnon Aguénounon, Michele Diana, Sylvain Lecler, Sylvain Gioux
ICube Laboratory, University of Strasbourg, 4 rue Kirschleger, 67085 Strasbourg Cedex, France
« Avancées techniques et applications de la LC-OCT pour l'imagerie in vivo de la peau à haute résolution »
Léna Waszczuk1,2, Jonas Ogien1, Arnaud Dubois1,2
1DAMAE Medical, 28 rue de Turbigo,75003 Paris, France
2Laboratoire Charles Fabry, Institut d'Optique Graduate School, Université Paris-Sud, 91127 Palaiseau Cedex, France
10H30-10H45 : PAUSE
10H45-12H05 : MICROSCOPIE (Animateurs : Sophie Brasselet, Nicolas Ducros)
« Optimization of illumination scanning in tomographic diffractive microscopy »
Asemare M. Taddese, Nicolas Verrier, Matthieu Debailleul, Jean-Baptiste Courbot, Olivier Haeberé
IRIMAS UR UHA 7499, University of Haute-Alsace, 61 rue Albert Camus, 68093 Mulhouse Cedex, France
« Super-résolution par effet Doppler »
Guillaume Noetinger, Sébastien Popoff, Fabrice Lemoult, Matthias Fink
Institut Langevin, ESPCI Paris, 1 rue Jussieu, 75005 PARIS, France
« Heterodyne holographic analysis of nanorods rotation to image microscale viscosity »
Clémence Gentner1, Robert Kuszelewicz1, Pascal Berto1,2, Jean-François Berret3, Gilles Tessier1
1Institut de la Vision, UMR 7210 CNRS, INSERM, Sorbonne Université, 17 rue Moreau, 75012 Paris, France
2Université Paris Descartes, 45 rue des Saints-Pères, 75006 Paris, France
3Matière et Systèmes Complexes, UMR 7057 CNRS, Université Paris Diderot, 10 rue Alice Domon et Léonie Duquet, 75205 Paris, France
« Microscope computationnel hyper spectral par feuillet de lumière structurée »
Sébastien Crombez1,2, Pierre Leclerc1,2, Nicolas Ducros1, Cédric Ray2
1Univ. Lyon, INSA-Lyon, UCB Lyon 1, UJM-Saint Étienne, CREATIS CNRS UMR 5220, INSERM U1206, F-69621, LYON, France
2Univ. Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, Institut Lumière Matière, F-69622, Villeurbanne, France
12H05-14H00 : DEJEUNER
14H00-15H40 : IMAGERIE POLARIMETRIQUE (Animateurs : Julien Fade, Frederic Galland)
« A general Framework for the training and evaluation of classifiers on polarimetric data »
Jean Rehbinder1, Christian Heinrich1, Angelo Pierangelo2, Jihad Zallat1
1ICube laboratory, University of Strasbourg, Bd Sébastien Brant, 67412 - Illkirch, France
2LPICM, CNRS, Ecole Polytechnique, Université Paris Saclay, Palaiseau, France
« Dans quelles conditions l'autocalibration de la retardance des imageurs à micro-grilles mesurant le vecteur de Stokes complet est-elle possible et utile ? »
Benjamin Le Teurnier1, Xiabo Li2,3, Matthieu Boffety1, Haofeng Hu2,3, François Goudail1
1Université Paris-Saclay, Institut d'Optique Graduate School, CNRS, Laboratoire Charles Fabry, Palaiseau, France
2School of Precision Instrument and Opto-electronics Engineering, Tianjin University, Tianjin 300072, Chine
3Key Laboratory of Opto-electronics Information Technology,Ministry of Education, Tianjin 300072, Chine
« Polarimetric imaging of two kinds of tumors in murine models »
Briséis Varin1, Jean Rehbinder1, Jean Dellinger1, Christian Heinrich1, Caroline Spenlé2, Dominique Bagnard2, Jihad Zallat1
1ICube laboratory, University of Strasbourg, Bd Sébastien Brant, 67412 Illkirch, France
2INSERM U1119 Labex Medalis, University of Strasbourg, Bd Sébastien Brant, 67412 Illkirch, France
« Réalisation d'images de dépolarisation spatiale par voie endoscopique pour la caractérisation de tissus biologiques in vivo »
Colman Buckley1, Marc Fabert1, Damien Kinet2, Dominique Pagnoux1
1Université de Limoges, Xlim, UMR n°7252, F-87000 Limoges, France
2Université de Mons, Faculté Polytechnique , Bd Dolez 31, B-7000Mons, Belgique
« Revisiting the Lu-Chipman decomposition »
Christian Heinrich, Jean Rehbinder, Jihad Zallat
ICube laboratory, University of Strasbourg, Bd Sébastien Brant, 67412 Illkirch, France
15H40-15H55 : PAUSE
15H55-16H55 : SESSION POSTERS (Animateurs : Corinne Fournier, Nicolas Verrier, Matthieu Boffety)
8H30-9H00 : ACCUEIL
09H00-09H40 : DESIGN OPTIQUE (Animateurs : Corinne Fournier, Nicolas Verrier)
« Design of a freeform prism/curved microdisplay for augmented reality applications »
Simon Charrière1,2, Pierre Joly2, Stéphane Nicolas2, Bertrand Simon3, Fabien Zuber2, Olivier Haeberlé1
1IRIMAS UR UHA 7499, University of Haute-Alsace, Mulhouse, France
2Université Grenoble Alpes, CEA, Leti, F-38000 Grenoble, France
3LP2N, CNRS UMR 5298, Université de Bordeaux, Institut d'Optique Graduate School, Talence, France
« Projection rétinienne par auto-focalisation, une approche technologique et théorique pour l'intégration des systèmes de Réalité Augmentée »
Christophe Martinez1, Matthias Colard1,3, Fabian Rainouard1,3,4, Kyllian Millard1,2, Paul Legentil1, Marie-Claude Gentet1, Yann Lee1, Sylvia Meunier-Della-Gata1, Cloé Bereyziat1, Olivier Haeberle3, Edouard Oudet4, Elise Ghibaudo2
1Univ. Grenoble Alpes, CEA, Leti, F-38000 Grenoble, France
2Univ. Grenoble Alpes, IMEP -LAHC, MINATEC -INPG, 38016 Grenoble, France
3Institut de Recherche en Informatique, Mathématiques, Automatique et Signal (IRIMAS EA7499), Univ. Haute-Alsace, 68093 Mulhouse Cedex, France
4Laboratoire Jean Kuntzmann, Univ. Grenoble Alpes, France
09H40-10H40 : INSTRUMENTATION ET DEVELOPPEMENTS (Animateurs : Corinne Fournier, Nicolas Verrier)
« Medium and Source Anisotropy in Noise-Correlation-based Elastography »
Agathe Marmin1, Simon Chatelin1, Manuel Flury1, Sybille Facca1,2, Stefan Catheline3, Amir Nahas1
1ICube, UMR 7357 CNRS, University of Strasbourg, 1 place de l'Hôpital, 67000 Strasbourg, France
2Department of Hand Surgery, SOS hand, University Hospital of Strasbourg, FMTS, ICube CNRS 7357, University of Strasbourg, 1 avenue Molière, 67000, Strasbourg, France
3LabTAU, Inserm U1032, 151 cours Albert Thomas, 69003 Lyon, France
« Real-Time, wide-field endoscopic quantitative imaging based on 3D profile corrected deep-learning SSOP»
L. Baratelli, E. Aguénounon, M. Flury, S. Gioux
ICube, Université de Strasbourg, CNRS, INSA, F-67000 Strasbourg, France
« Optimal observables for practical super-resolution imaging »
Giacomo Sorelli, Manuel Gessner, Mattia Walschaers, Nicolas Treps
Laboratoire Kastler Brossel, Sorbonne Université, ENS-Université PSL, CNRS, Collège de France, 4 Place Jussieu, F-75252 Paris, France
10H40-10H55 : PAUSE
10H55-12H35 : PROBLEMES INVERSES (Animateurs : Frédéric Champagnat, Mauro Dalla Mura)
« Approche inverse régularisée pour la reconstruction d'environnements circumstellaires en polarimétrie »
Laurence Denneulin1, Maud Langlois2, Nelly Pustelnik3, Éric Thiébaut2
1Laboratoire Hubert Curien UMR CNRS 5516, Université Jean Monnet, F-42000 Saint-Étienne, France
2Univ Lyon, Univ Lyon 1, Ens de Lyon, CNRS, Centre de Recherche Astrophysique de Lyon, UMR5574, F-69230 Saint-Genis-Laval, France
3Univ Lyon, ENS de Lyon, Univ Claude Bernard Lyon 1, CNRS, Laboratoire de Physique, F-69342 Lyon, France
« Dynamical reconstruction methods for Dual-Energy CBCT angiography »
Frédéric Jolivet, Johan Nuyts
Department of Imaging and Pathology, Division of Nuclear Medicine, KU/UZ Leuven, Leuven, Belgium
« Déflectométrie : un problème inverse mal conditionné »
Hugo Jonquière1,2
1ONERA, DOTA, 29 Avenue de la Division Leclerc, 92320 Châtillon, France
2SAFRAN REOSC, Avenue de la tour Maury, 91280 St Pierre du Perray
« Reconstruction conjointe d'échantillons biologiques et d'objets d'étalonnage pour la mise au point automatique en microscopie holographique »
Dylan Brault1, Anthony Berdeu2,3, Ferréol Soulez4, Fabien Momey1, Thomas Olivier1, Loïc Denis1, Corinne Fournier1
1Univ. Lyon, UJM-Saint-Etienne, CNRS, Institut of Optics Graduate School,Laboratoire Hubert Curien UMR 5516, F-42023, Saint-Etienne, France
2National Astronomical Research Institute of Thailand, 260 Moo 4, T. Donkaew, A. Maerim, Chiang Mai50180, Thailand
3Department of Physics, Faculty of Science, Chulalongkorn University, 254 Phayathai Road, Pathumwan, Bangkok 10330, Thailand
4Univ. de Lyon, Université Lyon 1, ENS de Lyon, CNRS, Centre de Recherche Astrophysique de Lyon, UMR5574, 69230 Saint-Genis-Laval, France
« Comparaison de modèles en déconvolution d'image par filtrage de Wiener : probabilité de modèles, évidence, approche de Chib, échantillonnage stochastique »
Benjamin Harroué1,2, Jean-François Giovannelli1, Marcelo Pereyra2
1Laboratoire IMS (Univ. Bordeaux / CNRS / BINP), Talence, France
2MACS, Heriot-Watt University, Edinburgh, United Kingdom
12H15-14H00 : DEJEUNER
14H00-15H20 : CO-CONCEPTION (Animateurs : Frédéric Galland, Corinne Fournier)
« Analyse théorique et expérimentale de masques de phase binaires co-optimisés pour augmenter la profondeur de champ de capteurs panchromatiques »
Alice Fontbonne, Hervé Sauer, François Goudail
Université Paris-Saclay, Institut d'Optique Graduate School, CNRS, Laboratoire Charles Fabry, 91127 Palaiseau, France
« Depth-From-Defocus Chromatique Actif par apprentissage de modèle de scène »
Benjamin Buat, Pauline Trouvé-Peloux, Frédéric Champagnat, Guy Le Besnerais
DTIS, ONERA, Université Paris-Saclay, FR-91123 Palaiseau, France
« Simulateur pour l'imagerie hyperspectrale compressée »
Antoine Rouxel1,2, Valentin Portmann3, Antoine Monmayrant2, Simon Lacroix2, Henri Camon2, Sebastien Lopez1
1Airbus Defence and Space, 31 Rue des Cosmonautes, 31400 Toulouse, France
2LAAS-CNRS, 7 Avenue du Colonel Roche, 31400 Toulouse, France
3IRAP, 9 Avenue du Colonel Roche, 31400 Toulouse, France
« Obtient-on de meilleures performances lorsqu'un système d'imagerie est co-optimisé avec un algorithme de déconvolution non linéaire ? »
Olivier Lévêque, Caroline Kulcsár, François Goudail
Université Paris-Saclay, Institut d'Optique Graduate School, CNRS, Laboratoire Charles Fabry, 91127,Palaiseau, France
15h20-15h35 : PAUSE
15H35-16H55 : DEEP-LEARNING ET MACHINE-LEARNING (Animateurs : Carole Frindel, Mauro Dalla Mura)
« Spectro-imagerie et apprentissage comprimé »
Clément Douarre1,2,3, Carlos Crispim Junior1, Anthony Gelibert3, Laure Tougne1, David Rousseau2
1Univ. Lyon, Université Lyon 2, LIRIS, UMR CNRS 5205, F-69676, Lyon, France
2Université d'Angers, LARIS, UMR INRAe IRHS, 62 Avenue Notre Dame du Lac, 49000 Angers, France
3Carbon Bee AgTech-11 rue, Parc du 45ème Parallèle-Rovaltain 26300 Chateauneuf-sur-Isere, France
« Vers une clarification numérique en imagerie des sphéroïdes »
Ali Ahmad1,2, Saba Goodarzi3, Carole Frindel1, Gaëlle Récher4, Charlotte Rivière3,5, David Rousseau2
1Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), CNRS UMR 5220-INSERM U1206, Université Lyon 1, Insa de Lyon, Villeurbanne, 69100, France
2Université d'Angers, LARIS, UMR INRAe IRHS, 62 Avenue Notre Dame du Lac, 49000 Angers, France
3Univ Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS UMR-5306, Institut Lumière Matière, F-69622, Villeurbanne, 69100, France
4BioImaging & OptoFluidics, LP2N, CNRS UMR 5298, IOGS, Université de Bordeaux, Talence, F-33400, France
5Institut Universitaire de France(IUF), France
« Approches en machine learning pour le traitement du bruit de speckle en holographie numérique »
Silvio Montrésor1, Marie Tahon2, Pascal Picart1,3
1LAUM UMR 6613, Le Mans Université, 72 000 Le Mans, France
2LIUM EA4023, Le Mans Université, 72 000 Le Mans, France
3ENSIM, Le Mans Université, 72 000 Le Mans, France
« Phase retrieval in X-ray in-line phase contrast imaging using Mixed Scale Dense convolutional networks »
Kannara Mom, Max Langer, Bruno Sixou
Univ Lyon, INSA-Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, UJM-Saint Etienne, CNRS, Inserm, CREATIS UMR 5220, U1206, F-69621,Villeurbanne, France
01 - « Vers une modélisation optique des signatures spectrales et polarimétriques d'objets »
M.Al Hayek1,2, J. Aval1, M. Elbouz1, B. El Hassan2
1Lab Isen-Yncréa Ouest, 20 Rue Cuirassé Bretagne ,29200 Brest, France
2Université Libanaise, Faculté de Génie-Branche 1,Campus Mont Michel Al Haykaliyeh, RasMaska, Al Koura, Liban Nord, Liban
02 - « Approche inverse non-supervisée pour la microscopie tomographique diffractive »
Laurence Denneulin, Fabien Momey, Dylan Brault
Laboratoire Hubert Curien UMR CNRS 5516, Université Jean Monnet, F-42000 Saint-Étienne, France
03 - « Orthogonality Breaking polarimetric microscopy of mitotic chromosomes »
Rajesh Desapogu1,2, Gilles Le Marchand1, Rebecca Smith1, Paulami Ray2, Émilie Gillier1,Stéphanie Dutertre3, Mehdi Alouini2, Marc Tramier1,3, Sébastien Huet1,3,4, Julien Fade2
1Univ Rennes, CNRS, IGDR, UMR 6290, F-35000 Rennes, France
2Univ Rennes, CNRS, Institut FOTON - UMR 6082, F-35000 Rennes, France
3Univ Rennes, BIOSIT, UMS CNRS 3480, US INSERM 018, F-35000 Rennes, France
4Institut Universitaire de France
04 - « Reconstruction Multimodale en Microscopie par Tomographie Diffractive en Transmission »
Steve Laroche, Nicolas Verrier, Jean-Baptiste Courbot, Matthieu Debailleul, Olivier Haeberlé
Institut de Recherche en Informatique, Mathématiques, Automatique et Signal (IRIMAS UR UHA 7499), Université de Haute-Alsace, IUT Mulhouse, 61 rue Albert Camus 68093 Mulhouse Cedex
05 - « Local spectroscopy and topography using white light interference microscopy »
S. Marbach, R. Claveau, F. Wang, J. Schiffler, P. Montgomery, M. Flury
ICube, Université de Strasbourg, CNRS, INSA, F-67000 Strasbourg, France
06 - « Microscope avec tomographie optique et reconstruction associée »
William Pierré1, Lionel Hervé1, Ondrej Mandula1, Vincent Remondière1, Sergei Grudinin2, Laura Waller3, Shwetadwip Chowdhury3, Magali Dhellemmes4, Christophe Arnoult4, Micha Ziemczonok5, Sophie Morales1, Cédric Allier1
1CEA - LETI/DTBS/LSIV, Grenoble
2INIRA, Grenoble, France
3Univ. of California, Berkeley
4CHU sur technique-bio-reproductive, Grenoble
5Warsaw University of Technology, Institute of Micromechanics and Photonics, Warsaw
07 - « Optimisation des stratégies d'acquisition en imagerie polarimétrique résolue à l'échelle du grain de speckle »
Jonathan Staes, Steve Bouhier, Julien Fade
Univ Rennes, CNRS, Institut FOTON, UMR6082, F-35000 Rennes, France
Virginie Chamard
« X-ray Bragg ptychography: a new approach to help deciphering biomineralization pathways »
Aix-Marseille Université, CNRS, Centrale Marseille, Institut Fresnel UMR 7249, Marseille, France
Biomineralization processes result in the production of outstandingly complex mineralized structures in living organisms (e. g., teeth, bones, shells, etc.). While they are still poorly understood to date, deciphering these mechanisms is of crucial importance: in materials science, it should provide bio-inspired strategies for the synthesis of nanostructured inorganic materials using soft chemistry and environmentally friendly processes; in paleoclimatology, strong impacts are also expected due to the use of biomineral proxies to perform paleoclimate reconstructions. On the contrary to the classical crystallization theory scheme, the production of most calcareous crystalline biominerals integrates several complex processes, likely based on the generic formation of a submicrometric granular structure. Hence, gaining access to the crystalline architecture at the mesoscale, i.e., over a few granules, is key to building realistic biomineralization scenarios. This is hindered by the difficulty to image complex crystalline materials at the nanoscale, one of today's major challenges of nanoscience. Answering this need would require a microscopy method combining sensitivity to the crystalline properties, 3D imaging capability, in situ compatibility and high spatial resolution. In this context, the recent advents of x-ray lensless imaging methods, based on Bragg coherent diffraction at third generation synchrotron sources, have opened promising perspectives, filling the gap between direct microscopies (AFM, SEM, TEM) and reciprocal-space based x-ray Bragg diffraction analysis. The decisive answer has been brought by 3D Bragg ptychography microscopy [2], which merges concepts developed in inverse microscopy and crystallography. This x-ray Bragg microscopy fully meets the requirements imposed by the structural investigation of biominerals. In this presentation, the general concepts of Bragg ptychography will be detailed, illustrated by recently proposed developments [2-7]. I will further describe how Bragg ptychography can be exploited to bring new insights on the biomineral crystalline structure. Perspectives with respects to the understanding of the biomineralization mechanisms will be finally presented [8]. This project has received funding from the European Research Council (ERC) under the European Union's Horizon H2020 research and innovation program grant agreement No 724881.
References
[1] M. A. Pfeifer, et al., Nature 442, 63 (2006). A. Ulvestad, et al., Science 348, 1344-1347 (2015).
[2] P. Godard, et al., Nature Communications 2, 568 (2011).
[3] P. Godard, et al., Optics Express 20, 25914 (2012).
[4] F. Berenguer, et al., Physical Review B 88, 144101 (2013).
[5] A. I. Pateras, et al., Physical Review B 92, 205305 (2015).
[6] V. Chamard, et al., Scientific Reports 5, 9827 (2015).
[7] S. O. Hruszkewycz, et al., Nature Materials 16, 244 (2017).
[8] F. Mastropietro, et al., Nature Materials 16, 946 (2017).
Date : du 2021-03-31 au 2021-04-01
Lieu : En ligne
Thèmes scientifiques :
B - Image et Vision
Inscriptions closes à cette réunion.
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